Jos litiumakkuja varastoidaan elektrodit täyteen ladattuina tai tyhjinä pitkän aikaa, niiden sisäinen elektrodirakenne vaurioituu. Täyteen ladattuna positiivinen elektrodimateriaali on altis vapauttamaan litiumdendriittejä, jotka voivat puhkaista erottimen ja aiheuttaa oikosulun; tyhjennetyssä tilassa (alle 20 % akun teholla) negatiivisen elektrodin aktiivinen materiaali hapettuu, mikä nopeuttaa kapasiteetin menetystä. Oikea tapa on säilyttää akku 50 %-60 % lataustasolla ennen sen asettamista sivuun. Tämä alue voi estää liialliset elektrodireaktiot ja myös estää akun menettämästä virtaa itsepurkautumisesta varastoinnin aikana. Esimerkkinä matkapuhelimen akut, jos ne jätetään käyttämättä pitkäksi aikaa, ne voidaan ensin ladata noin 55 %:iin, sitten sammuttaa ja varastoida. Myöhempi suorituskyvyn säilyvyysaste on yli 30 % korkeampi kuin täydellä teholla varastoituna.
Lämpötilan suhteen tulee välttää äärimmäisiä korkeita ja matalia lämpötiloja. Ihanteellinen säilytyslämpötila on 10 astetta - 25 astetta. Korkeat lämpötilat nopeuttavat elektrolyytin hajoamista, kun taas alhaiset lämpötilat voivat lisätä akun sisäistä vastusta. Kosteuden suhteen on välttämätöntä pysyä poissa kosteista ympäristöistä, kuten kylpyhuoneista ja kellareista. Akku voidaan laittaa suljettuun pussiin tai kosteudenkestävään-laatikkoon. Tarvittaessa voidaan käyttää kuivausainetta estämään kosteuden pääsy akkuun ja aiheuttaa liitäntäkorroosiota tai sisäisten komponenttien oikosulkuja. Lisäksi säilytyksen aikana akku ei saa joutua kosketuksiin metalliesineiden (kuten avainten ja kolikoiden) kanssa, jotta vältetään vahingossa tapahtuva oikosulku, joka johtuu positiivisen ja negatiivisen elektrodin odottamattomasta kosketuksesta. Älä myöskään purista akkua, jotta kuori ei vaurioidu, mikä voi johtaa elektrolyytin vuotamiseen.
Jopa lepotilassa litiumakuissa on silti pieni itsepurkautumisilmiö. On suositeltavaa tarkistaa ja ladata akku 3–6 kuukauden välein: Mittaa ensin akun jännite (normaalin jännitteen tulee olla välillä 3,6–3,8 V, mikä vastaa 50–60 % akun varausta). Jos jännite on alle 3,5 V, se on ladattava alkuperäisellä laturilla 50–60 %:iin ja jatkettava säilytystä. tarkkaile samalla akun ulkonäköä. Jos huomaat, että kuori pullistuu, vääntyy tai vuotaa, lopeta varastointi välittömästi ja käsittele sitä oikein. Älä käytä sitä uudelleen. Laitteissa, kuten kannettavissa tietokoneissa ja virtapankeissa, jos koko laite on pitkään käyttämättömänä, on myös suositeltavaa kytkeä se päälle ja tarkistaa akun tila tämän jakson mukaisesti, jotta vältetään akun liiallinen purkautuminen laitteen taustavirrankulutuksesta.

